Magnētiskie sūkņi galvenokārt ir piemēroti šķidru vielu transportēšanai, kas nesatur cietas daļiņas, nav korozijas, ar zemu temperatūru un augstas noplūdes prasības. Tomēr magnētiskie sūkņi nav piemēroti visu veidu nesējiem. Tālāk ir minēti daži materiāli, kuru transportēšanai magnētiskie sūkņi nav piemēroti:
*Šķidrumi, kas satur lielu skaitu cietu daļiņu: magnētiskā sūkņa magnētiskā savienojuma transmisijas struktūru var nodilt un bloķēt cietas daļiņas, tādējādi ietekmējot sūkņa veiktspēju un kalpošanas laiku.
*Augstas temperatūras šķidrumi: magnētiskā sūkņa magnētiskā savienojuma pārvades sistēma ir jutīga pret temperatūru. Pārmērīgas temperatūras dēļ magnētiskais materiāls vājinās vai pat zaudēs savu magnētismu, ietekmējot normālu sūkņa darbību.
*Uzliesmojoši un sprādzienbīstami šķidrumi: magnētiskie sūkņi darbības laikā var radīt zināmu magnētiskā lauka noplūdi, kas var izraisīt uzliesmojošu un sprādzienbīstamu šķidrumu aizdegšanos vai eksploziju.
* Augstas viskozitātes šķidrumi: augstas viskozitātes šķidrumi palielinās berzes pretestību sūkņa iekšienē, samazina sūkņa efektivitāti un augstumu, kā arī var izraisīt sūkņa darbības traucējumus.
*Pret magnētiskajiem laukiem jutīgi šķidrumi: šķidrumus, kas ir jutīgi pret magnētiskajiem laukiem, magnētiskais lauks var ietekmēt, kad tos transportē ar magnētiskiem sūkņiem, izraisot šķidruma īpašību izmaiņas.
*Ļoti kodīgi šķidrumi: lai gan magnētiskie sūkņi ir piemēroti noteiktu korozīvu šķidrumu pārvadīšanai, ļoti kodīgiem šķidrumiem, piemēram, augstas koncentrācijas skābēm un sārmiem, ir jāizvēlas magnētiskie sūkņi, kas izgatavoti no īpašiem materiāliem, pretējā gadījumā sūkņa materiāls var būt stipri korozējis. .
Izmantojot magnētisko sūkni barotnes transportēšanai, ir jāizvēlas atbilstošs magnētiskā sūkņa modelis un materiāls atbilstoši konkrētās vides īpašībām, lai nodrošinātu drošu un uzticamu sūkņa darbību.