Magnētiskajiem sūkņiem ir šādas priekšrocības salīdzinājumā ar tradicionālajiem mehānisko blīvējumu sūkņiem:
Nav noplūdes: magnētiskos sūkņus darbina magnētisks spēks, un tiem nav nepieciešamas mehāniskas blīves. Tie var nodrošināt patiesu darbību bez noplūdēm un izvairīties no piesārņojuma un kaitējuma videi un aprīkojumam, ko izraisa šķidruma noplūde.
Nav piesārņojuma: Tā kā nav mehāniskā blīvējuma, magnētiskajiem sūkņiem nav piesārņojuma problēmu, ko izraisa noplūde, un tie ir piemēroti gaistošu, toksisku, kaitīgu, uzliesmojošu un citu īpašu datu nesēju transportēšanai.
Bez berzes: starp lāpstiņriteni un magnētiskā sūkņa sūkņa korpusu nav kontakta, kas ļauj izvairīties no nodiluma un enerģijas patēriņa, ko izraisa tradicionālo mehānisko sūkņu berze.
Nav sūkņa noplūdes: magnētiskais sūknis izmanto statiskas vai dinamiskas blīves, lai nodrošinātu sūkņa darbību bez noplūdēm, izvairoties no šķidruma izšķērdēšanas un piesārņojuma, ko izraisa sūkņa noplūde tradicionālajos mehāniskajos sūkņos.
Zems trokšņa līmenis: Tā kā magnētiskā sūkņa lāpstiņritenim nav tieši jāsaskaras ar gultni, troksnis ir zemāks nekā tradicionālajiem mehāniskajiem sūkņiem.
Tomēr magnētiskajiem sūkņiem ir arī daži trūkumi:
Augstas izmaksas: magnētiskajos sūkņos tiek izmantotas progresīvas tehnoloģijas un materiāli, un izmaksas ir salīdzinoši augstas, tāpēc arī cena ir augstāka nekā tradicionālajiem mehāniskajiem sūkņiem.
Zema efektivitāte: tā kā magnētiskā sūkņa magnētiskā spēka pārveidošanas efektivitāte nav tik augsta kā mehāniskās transmisijas efektivitāte, energoefektivitāte ir nedaudz zemāka.
Nepieciešama profesionāla apkope: magnētiskā sūkņa darbības princips atšķiras no tradicionālā mehāniskā sūkņa darbības principa, tāpēc tam nepieciešama profesionāla apkope un aprūpe.